数学物理湖北省重点实验室 2025 年度开放课题基金：基于人工智能的空间反卷积与差异表表
法基因方法研究，
MPL20250RG013
，经费:
2
万元，
2025/07—2026/12
,主持。
华中师范大学
2019
年度优秀博士学位论文培育计划项目：面向单细胞测序数据的填充算法研
究，
No. 2019YBZZ058
，经费:
2
万元，
2019/09—2021/06
,主持（当年学院只提供了 12 个项目
名额)。
华中师范大学
2018
年度研究生教育创新资助项目：整合多组学数据的基因网络重布局分析，
No. 2018CXZZ091
，经费：
1
万元，
2018/09
—
2019/06
，主持（当年学院只提供了 12 个项目名
额)。
国家自然科学基金面上项目：基于稀疏概率图模型的多癌症多组学生物网络构建方法研究，
No.
11871026
，经费
53
万元,
2019/01
—
2021/12
。学生排名第
1
，职责：主要负责构建稀疏概率图模
型的多癌症多组学生物网络模型。目前在此项目的支持下，申请人基于概率图模型的算法理论
与模型构建，在生物信息学领域的权威期刊
Bioinformatics
上发表学术论文
3
篇。
已发表的论文
1. 涂佳娟,
H.Yan, X. F.Zhang, Z. Lin. Precise gene expression deconvolution in spatial transcriptomics
with STged.
Nucleic acids research
, 2025,53(4), gkaf087.(
JCR-Q1
, IF: 16.8
，
top5%
,
中国自动化
学会
T1+
类).
2. 涂佳娟,
H. S. Li, H. Yan, X. F. Zhang, EnDecon: cell type deconvolution of spatially resolved
transcriptomics data via ensemble learning.
Bioinformatics
, 2023, 39(1), btac825. (
JCR-Q1
, IF: 5.8
，
top5%
,
中国数学学会
T1
类).
3.
涂佳娟
,
L. Ou-Yang, H. Yan, H. Qin, X. F. Zhang, Differential network analysis by simultaneously
considering changes in gene interactions and gene expression,
Bioinformatics
,
2021, 37(23),
4414-4423. (
JCR-Q1
, IF: 5.8
，
top5%,
中国数学学会
T1
类
).
4.
涂佳娟
,
L. Ou-Yang, H. Yan, X. F. Zhang, H. Qin, Joint reconstruction of multiple gene networks by
simultaneously capturing inter-tumour and intra-tumour heterogeneity,
Bioinformatics
,
2020, 36(9),
2755-2762
.
(
JCR-Q1
, IF: 5.8
，
top5%,
中国数学学会
T1
类
).
5.
涂 佳 娟
,
L. Ou-Yang, X. Hu, X. F. Zhang, Inferring gene network rewiring by combining gene
expression with gene mutation data,
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and
Bioinformatics
, 2019, 16(3): 1042-1048. (
JCR-Q1
, IF: 4.5).
6. Liu Y, Liu Y,
涂 佳 娟
, et al. ABCD1 as a Novel Diagnostic Marker for Solid Pseudopapillary
Neoplasm of the Pancreas,
The American Journal of Surgical Pathology,
2024, 48(5): 511-520.,
(
JCR-Q1
, IF: 5.6) (
第二作者，申请人负责所有生物医学大数据模型设计和计算分析
).
